Les équipes-projets du centre sont communes avec les partenaires académiques suivants : université de Bordeaux, université de Pau et des Pays de l’Adour, Bordeaux INP, ENSTA ParisTech, l'INRA, l'Inserm et le CNRS.
Le centre a également de nombreux autres partenariats :
- Acteurs de la recherche : CHU, Bergonié, IHY Liryc, Vaccine institute, CEA CESTA
- Écosystème d'innovation : Aerospace Valley, Alpha-RLH, Digital Aquitaine, Aquitaine Robotics, Thalès, GIS Albatros, CATIE, Aquitaine Science Transfert, Bordeaux Unitec, Bordeaux Technowest, French Tech Bordeaux, Cap Sciences,
- Collectivités territoriales : région Nouvelle-Aquitaine ;
- Entreprises :
- Startups : Siderion Technologies, Rhoban Systems, IQSpot, Matchable, Pollen Robotics, RealityTech, Ullo, (Nenuphar), UT4H, Nurea, Atoptima, TouchSensity, Luos Robotics……
- PME-ETI : I2S, Valeol, Sophia Genetics, SimForHealth, AlgoTech, Evolise, Valorem, Itwell, MieuxPlacer.com, Akiani, Poietis, Exoes, EvidenceB
- Grands groupes : Total, EDF, Thalès, Airbus Group, Atos-Bull, Naval Group, Safran, INTEL, Roche, Ubisoft, MicroSoft Research, PSA, Suez...
- Partenaires académiques internationaux : Université des Sciences et Technologies de Lasuku (Gabon), Ecole Nationale des Ingénieurs de Tunis (Tunisie), Max Plank Institut (Allemagne), Lawrence Berkeley National Laboratory (USA), Harvard University (USA), RAND Corporation (USA), Duke University (USA), Stanford University (USA), Roswell Park Cancer Institute (USA), University of California, Santa Barbara (USA)